Mediante Ley de Gobierno 10555 de fecha 24 de abril de 1946 se crea la Facultad de Química. El 9 de diciembre de 1983 la Ley Universitaria Nº 23733 dio por finalizado el sistema de departamentos académicos profesionales y dio paso las actuales Escuelas Académico Profesionales. Tras la elaboración del Estatuto de la Universidad que la Asamblea Universitaria promulgó el 22 de setiembre de 1984, nació la Facultad de Química cambia de denominación: Facultad de Química e Ingeniería Química con sus dos Escuelas Académico Profesionales de: Química e Ingeniería Química. Estas dos profesiones son afines y complementarias en la vida práctica, pero claramente diferenciadas en sus funciones y aplicaciones en la industria. El 30 de noviembre de diciembre del 2005 mediante Resolución Rectoral N°06803-R-05 se creó una nueva Escuela con sede en el distrito de San Juan de Lurigancho: la Escuela Académico Profesional de Ingeniería Agroindustrial.